GGGenome Help | English

データベース：
 

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-10 17:34:35, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Daucus carota delta12-fatty acid acetylenase gene, partial cds.
AY166774.1:111-130
TGCCCTTTACTATGTTGCCACGAATTACAT111AGACCAGTACCTTCCGCATCCTCTTAATTACTTGGGATGGGCGGCTTACA
Daucus carota subsp. sativus cultivar DH1 chromosome 8.
CP093350.1:22755303-22755322
TGTAAGCCGCCCATCCCAAGTAATTAAGAG22755303GATGCGGAAGGTACTGGTCTATGTAATTCGTGGCAACATAGTAAAGGGCA
Daucus carota isolate Kuroda chromosome 8.
CP125308.1:35069091-35069110
TGTAAGCCGCCCATCCCAAGTAATTAAGAG35069091GATGCGGAAGGTACTGGTCTATGTAATTCGTGGCAACATAGTAAAGGGCA

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/AGACCAGTACCTTCCGCATC
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : AGACCAGTACCTTCCGCATC | format : html | download : | debug : 

0.008 | 0.008 | search_start;
0.369 | 0.361 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=AGACCAGTACCTTCCGCATC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.459 | 0.090 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GATGCGGAAGGTACTGGTCT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=49
0.460 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
This page is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License (CC BY 4.0).