GGGenome Help | English

データベース:

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 +方向のみ検索 -方向のみ検索

2025-04-13 01:36:40, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

Arachis ipaensis cultivar K30076 chromosome 04.
CP049895.1:44327794-44327813
TTTTATTCCTTACAGTAAAAATGACAAGCA44327794AGAGCGAAGGTGGAAACAAATACAATGTAACACACACACACACACACACA
Arachis hypogaea DNA, clone: AHGS44J10.
DH961634.1:365-384
TGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTACATTGTA365TTTGTTTCCACCTTCGCTCTTGCTTGTCATTTTTACTGTAAGGAATAAAA
Arachis hypogaea cultivar Shitouqi chromosome B04.
CP030996.1:85136172-85136191
TGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTACATTGTA85136172TTTGTTTCCACCTTCGCTCTTGCTTGTCATTTTTACTGTAAGGAATAAAA

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/AGAGCGAAGGTGGAAACAAA
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : AGAGCGAAGGTGGAAACAAA | format : html | download : | debug :

0.009 | 0.009 | search_start;
0.334 | 0.325 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=AGAGCGAAGGTGGAAACAAA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.474 | 0.140 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TTTGTTTCCACCTTCGCTCT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=49
0.475 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
This page is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License (CC BY 4.0).