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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-03-14 19:05:56, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

RS2BJ82JQ RS2(RS) Raphanus sativus cDNA 3', mRNA sequence.
EX898793.1:609-630
CTTGGGGAACTCTGGGTCACCAGTACCGAG609AGAGGCTTCGTCCTTCATGAGTCTCTCGTTGACCTTGTTGTGCGTGCTCCAC
TSA: Raphanus sativus var. sativus RNA, contig: WG3_9400.
FX667890.1:540-561
CTTGGGGAACTCGGGGTCACCGGTACCGAG540AGAGGCTTCGTCCTTCATGAGTCTCTCGTTGACCTTGTTGTGCGTGCTCCAC
RS2DH73TF RS2(RS) Raphanus sativus cDNA 5', mRNA sequence.
EY938250.1:294-315
GTGGAGCACGCACAACAAGGTCAACGAGAG294ACTCATGAAGGACGAAGCCTCTCTCGGTACTGGTGACCCAGAGTTCCCCAAG

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/AGAGGCTTCGTCCTTCATGAGT
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : AGAGGCTTCGTCCTTCATGAGT | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.356 | 0.347 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=AGAGGCTTCGTCCTTCATGAGT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.519 | 0.164 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=ACTCATGAAGGACGAAGCCTCT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.520 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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