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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
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2025-04-03 12:11:49, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Malus hybrid cultivar cultivar Flame chromosome 11.
CP141920.1:2546926-2546945
TTTTATTCCCACCCTTCTGCCTTTGCTTAA2546926AGATACAGACCCGCAACACCTTCATTTGGTCAGCACATCTGTGCACATTT
Malus hybrid cultivar cultivar Flame chromosome 11.
CP141937.1:2621614-2621633
TTTTATTCCCACCCTTCTGCCTTTGCTTAA2621614AGATACAGACCCGCAACACCTTCATTTGGTCAGCACATCTGTGCACATTT
Malus hybrid cultivar cultivar Royalty chromosome 11.
CP141963.1:2701316-2701335
TTTTATTCCCACCCTTCTGCCTTTGCTTAA2701316AGATACAGACCCGCAACACCTTCATTTGGTCAGCACATCTGTGCACATTT
Malus hybrid cultivar cultivar Royalty chromosome 11.
CP141980.1:2691888-2691907
TTTTATTCCCACCCTTCTGCCTTTGCTTAA2691888AGATACAGACCCGCAACACCTTCATTTGGTCAGCACATCTGTGCACATTT
Malus hybrid cultivar cultivar SH6 chromosome 11.
CP143368.1:2608192-2608211
TTTTATTCCCACCCTTCTGCCTTTGCTTAA2608192AGATACAGACCCGCAACACCTTCATTTGGTCAGCACATCTGTGCACATTT
Malus hybrid cultivar cultivar SH6 chromosome 11.
CP143385.1:2621492-2621511
TTTTATTCCCACCCTTCTACCTTTGCTTAA2621492AGATACAGACCCGCAACACCTTCATTTGGTCAGCACATCTGTGCACATTT
Malus sylvestris genome assembly, chromosome: 11.
OU696513.1:2715890-2715909
TTTTATTCCCACCCTTCTGCCTTTGCTTAA2715890AGATACAGACCCGCAACACCTTCATTTGGTCAGCACATCTGTGCACATTT
Malus domestica genome assembly, chromosome: 11.
OU696687.1:2704149-2704168
TTTTATTCCCACCCTTCTGCCTTTGCTTAA2704149AGATACAGACCCGCAACACCTTCATTTGGTCAGCACATCTGTGCACATTT
Malus domestica genome assembly, chromosome: 11.
OU744552.1:2781161-2781180
TTTTATTCCCACCCTTCTGCCTTTGCTTAA2781161AGATACAGACCCGCAACACCTTCATTTGGTCAGCACATCTGTGCACATTT
Malus domestica genome assembly, chromosome: 11.
OU744963.1:2821113-2821132
TTTTATTCCCACCCTTCTGCCTTTGCTTAA2821113AGATACAGACCCGCAACACCTTCATTTGGTCAGCACATCTGTGCACATTT
Malus domestica genome assembly, chromosome: 11.
OU745001.1:2765374-2765393
TTTTATTCCCACCCTTCTGCCTTTGCTTAA2765374AGATACAGACCCGCAACACCTTCATTTGGTCAGCACATCTGTGCACATTT
Malus x robusta genome assembly, chromosome: 5.
OY720329.1:38508529-38508548
AAATGTGCACAGATGTGCTGACCAAATGAA38508529GGTGTTGCGGGTCTGTATCTTTAAGCAAAGGCAGAAGGGTGGGAATAAAA

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/AGATACAGACCCGCAACACC
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : AGATACAGACCCGCAACACC | format : html | download : | debug : 

0.008 | 0.008 | search_start;
0.328 | 0.320 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=AGATACAGACCCGCAACACC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.421 | 0.093 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GGTGTTGCGGGTCTGTATCT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=39
0.422 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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