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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-03-17 15:42:09, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Martes martes genome assembly, chromosome: 1.
OY734063.1:196774777-196774796
TCCCTTCAGGTGGTCTCCGCAGACCCAAGA196774777AGCAGAGGAGTCTCCACCAAGTCAGAGCTCATGCTGATAACTGGGTTTCC
Trifolium repens mRNA, clone: WCC01j18_086, unspecified EST.
FY454863.1:274-293
GAACTAATTAAAAGCGTTCCCTGTTCTTGA274AGCAGAGGAGTCTCCACCAAAATCCATAAACCTCATAAGTTGTTGAAAAT
Trifolium repens isolate ACLI19 chromosome 04_Pall.
CP125843.1:15285651-15285670
GAACTAATTAAAAGCGTTCCCTGTTCTTGA15285651AGCAGAGGAGTCTCCACCAAAATCCATAAACCTCATAAGTTGTTGAAAAT
Trifolium repens mRNA, clone: WCC01j18_5, unspecified EST.
FY454864.1:676-695
ATTTTCAACAACTTATGAGGTTTATGGATT676TTGGTGGAGACTCCTCTGCTTCAAGAACAGGGAACGCTTTTAATTAGTTC

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/AGCAGAGGAGTCTCCACCAA
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : AGCAGAGGAGTCTCCACCAA | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.173 | 0.164 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=AGCAGAGGAGTCTCCACCAA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.288 | 0.115 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TTGGTGGAGACTCCTCTGCT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=47
0.289 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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