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データベース：
 

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-03 15:33:07, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Daucus carota subsp. sativus cultivar DH1 chromosome 4.
CP093346.1:44685471-44685490
CGTGAGCGAATCGAAATCTTGATCTCGAAT44685471GCAGGGATTCTCGCAATGCTTTACGCGCTCTATCTTCTAACCGTCGCCAA
Daucus carota isolate Kuroda chromosome 4.
CP125304.1:32974465-32974484
CGTGAGCGAATCGAAATCTTGATCTCGAAT32974465GCAGGGATTCTCGCAATGCTTTACGCGCTCTATCTTCTAACCGTCGCCAA
Haemonchus contortus strain NZ_Hco_NP chromosome 5.
CP035803.1:46618117-46618136
TCCCGCGTATATGTATGGGCTCTCGAAGCG46618117GCAGGGATTCTCGCAATGCTTGAAGAAAGTCTGGCCAAAGACGTTTTTTC

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/AGCATTGCGAGAATCCCTGC
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : AGCATTGCGAGAATCCCTGC | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.162 | 0.153 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=AGCATTGCGAGAATCCCTGC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.241 | 0.079 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GCAGGGATTCTCGCAATGCT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.244 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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