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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-03 12:08:30, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Brassica rapa subsp. pekinensis clone KBrH125B21, complete sequence.
FP340387.1:30088-30107
ACTAGGGGGACAAGCGGTGCGACCGCCCCG30088AGCCCAAGCTCGTATTCCTTCGTATAATAATAATTTTTATAAATTTATAT
Brassica rapa genome, scaffold: A06.
LR031569.1:8381054-8381073
ACTAGGGGGACAAGCGGTGCGACCGCCCCG8381054AGCCCAAGCTCGTATTCCTTCGTATAATAATAATTTTTATAAATTTATAT
Brassica rapa genome assembly, chromosome: A06.
LS974622.2:9217956-9217975
ACTAGGGGGACAAGCGGTGCGACCGCCCCG9217956AGCCCAAGCTCGTATTCCTTCGTATAATAATAATTTTTATAAATTTATAT
Brassica rapa subsp. pekinensis cultivar Inbred line 'Chiifu' clone KBrH006P24, complete sequence.
AC189558.2:67430-67449
ATATAAATTTATAAAAATTATTATTATACG67430AAGGAATACGAGCTTGGGCTCGGGGCGGTCGCACCGCTTGTCCCCCTAGT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/AGCCCAAGCTCGTATTCCTT
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : AGCCCAAGCTCGTATTCCTT | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.203 | 0.194 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=AGCCCAAGCTCGTATTCCTT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.278 | 0.075 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=AAGGAATACGAGCTTGGGCT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=47
0.279 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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