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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-08 05:08:17, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Capricornis sumatraensis isolate serow.1 chromosome 8.
CP135634.1:46909562-46909580
TTGAAACTGCTGTTTGTGCCTGGATAGTCC46909562AGCCCTTACATGTATTCAGCTGTCCCCATTAATAGAAAGTAACCAGTAG
Tridacna gigas genome assembly, chromosome: 9.
OX244036.2:16032063-16032081
TTATTGCTGACAATTAATTCATGACTATAA16032063AGCCCTTACATGTATTCAGCTTTTGCAAGTGGTACAAAGGAGAAATATT
Lamellibrachia columna genome assembly, chromosome: 14.
OY759274.1:32358306-32358324
TACATCATAATGACAAGCAAAGATTGCAAT32358306AGCCCTTACATGTATTCAGGATGACCAGTAACCTGTCAGGATGACCAGT
Ovis canadensis canadensis isolate 43U chromosome 21 sequence.
CP011906.1:2978101-2978119
CTACTGGTTACTTTCTGTTAATGGGGACAG2978101CTGAATACATGTAAGGGCTGGACTATCCAGGCACAAAGAGCAGTTGTMA
Eudonia mercurella genome assembly, chromosome: 29.
OY720051.1:9822954-9822972
AATGTGGACATTCACTGCCAAAACTTGCAG9822954CTGAATACATGTAAGGGCTGTTTTTTCAATTCTCATATAAAAATTAAAC

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/AGCCCTTACATGTATTCAG
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : AGCCCTTACATGTATTCAG | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.345 | 0.336 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=AGCCCTTACATGTATTCAG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.448 | 0.103 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CTGAATACATGTAAGGGCT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=47
0.449 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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