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データベース:

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
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2025-04-03 12:51:48, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

Arachis hypogaea cultivar Shitouqi chromosome B03.
CP030995.1:141835895-141835914
TCCATCATTGAATAGGTCATGAAAATTGTG141835895AGCCTTGCGACTAGGTTCATTGTATAAGTACGGCAACTCCACCACATCCC
Ananas comosus genome assembly, chromosome: 19.
LR828299.1:455879-455898
GATACACCAAAAATATATCAAACCACAAAC455879ATGAACCTAGTCGCAAGGCTAACCGTCGAAGAGGCGCCTACGCTTGCGAT
Ananas comosus var. bracteatus genome assembly, chromosome: 21.
LR862149.1:1430967-1430986
GATACACCAAAAATATATCAAACCACAAAC1430967ATGAACCTAGTCGCAAGGCTAACCGTCGAAGAGGCGCCTACGCTTGCGAT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/AGCCTTGCGACTAGGTTCAT
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : AGCCTTGCGACTAGGTTCAT | format : html | download : | debug :

0.009 | 0.009 | search_start;
0.136 | 0.127 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=AGCCTTGCGACTAGGTTCAT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.202 | 0.066 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=ATGAACCTAGTCGCAAGGCT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=49
0.204 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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