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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
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2025-04-08 02:39:06, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

Lotus japonicus genomic DNA, chromosome 2, clone: LjT06K11, TM0002.
AP004467.1:1604-1622
TGAAAATGCATCAGAGGGAGGAAACTAATT1604AGCGATCTACATTCAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGTG
Pyrrhosoma nymphula genome assembly, chromosome: 8.
OY754335.1:15195005-15195023
ATTATTTACCTTCCTCTTCCGTGCTTTCCC15195005AGCGATCTACATTCAAGAGTAATCTTCATCATCCCTCTGTTCTCGCGCT
Lotus japonicus genomic DNA, chromosome 2, clone: LjT14P21, TM0929.
AP007687.2:5068-5086
CACTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCT5068CTCTTGAATGTAGATCGCTAATTAGTTTCCTCCCTCTGATGCATTTTCA
Lotus japonicus B-129 DNA, chromosome 1, complete sequence.
AP022629.1:11010033-11010051
CTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCT11010033CTCTTGAATGTAGATCGCTAATTAGTTTCCTCCCTCTGATGCATTTTCA

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/AGCGATCTACATTCAAGAG
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : AGCGATCTACATTCAAGAG | format : html | download : | debug :

0.008 | 0.008 | search_start;
0.178 | 0.170 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=AGCGATCTACATTCAAGAG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.267 | 0.089 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CTCTTGAATGTAGATCGCT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.268 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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