GGGenome Help | English

データベース：
 

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-03 11:54:33, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Arachis hypogaea DNA, clone: NYHA00A21, cultivar: Nakateyutaka.
DE998913.1:221-240
TAACTGGTACTCCGATCTCACCCTATTAGG221AGGGTGCCTAGCCTTGTTTTCGTATGATCACATAGGTAAAACTTATATAT
Arachis hypogaea DNA, clone: SATE0377.
DH968562.1:276-295
ATATATAAGTTTTACCTATGTGATCATACG276AAAACAAGGCTAGGCACCCTCCTAATAGGGTGAGATCGGAGTGCTTCTAC
Arachis hypogaea cultivar Shitouqi chromosome A04.
CP030986.1:118797138-118797157
ATATATAAGTTTTACCTATGTGATCATACG118797138AAAACAAGGCTAGGCACCCTCCTAATAGGGTGAGATCGGAGTACCAGTTA

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/AGGGTGCCTAGCCTTGTTTT
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : AGGGTGCCTAGCCTTGTTTT | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.201 | 0.193 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=AGGGTGCCTAGCCTTGTTTT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.310 | 0.109 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=AAAACAAGGCTAGGCACCCT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=49
0.312 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
This page is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License (CC BY 4.0).