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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-05 15:44:37, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Porphyra yezoensis cDNA, clone:PF030f06_r, 5'end.
AU188808.1:302-320
CGGCGTCTGGACAGATGTGCGGCTGCGGCG302ACTTGTCATGCTTGGCCCTTCGGTGGTGGGCAAGTCGGCCGTGACCATC
Porphyra yezoensis cDNA, clone:PF039a04_r, 5'end.
AU189427.1:231-249
CGGCGTCTGGACAGATGTGCGGCTGCGGCG231ACTTGTCATGCTTGGCCCTTCGGTGGTGGGCAAGTCGGCCGTGACCATC
Porphyra yezoensis cDNA clone:PM056a09_r, 5' end.
AV435340.1:318-336
CGGCGTCTGGACAGATGTGCGGCTGCGGCG318ACTTGTCATGCTTGGCCCTTCGGTGGTGGGCAAGTCGGCCGTGACCATC

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/AGGGccaAGCATGACAAGT
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : AGGGccaAGCATGACAAGT | format : html | download : | debug : 

0.008 | 0.008 | search_start;
0.362 | 0.354 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=AGGGCCAAGCATGACAAGT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.494 | 0.132 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=ACTTGTCATGCTTGGCCCT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.496 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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