GGGenome Help | English

データベース:

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 +方向のみ検索 -方向のみ検索

2025-04-11 20:42:49, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

Arachis hypogaea DNA, clone: AHGS42O24.
DH961687.1:109-128
TGCTAATCTTAAAGGTTTTAGCCCAAAGTT109AGGTCAAACGCACCAAAAACGTTAATGGGTTGGACTGGGCCTAAATCGGA
Arachis hypogaea cultivar Shitouqi chromosome B06.
CP030998.1:36874727-36874746
TCCGATTTAGGCCCAGTCCAACCCATTAAC36874727GTTTTTGGTGCGTTTGACCTAACTTTGGGCTAAAACCTTTAAGATTAGCA
Arachis ipaensis cultivar K30076 chromosome 06.
CP049897.1:33492690-33492709
TCCGATTTAGGCCCAGTCCAACCCATTAAC33492690GTTTTTGGTGCGTTTGACCTAACTTTGGGCTAAAACCTTTAAGATTAGCA

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/AGGTCAAACGCACCAAAAAC
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : AGGTCAAACGCACCAAAAAC | format : html | download : | debug :

0.008 | 0.008 | search_start;
0.372 | 0.363 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=AGGTCAAACGCACCAAAAAC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.475 | 0.103 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GTTTTTGGTGCGTTTGACCT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=49
0.476 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
This page is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License (CC BY 4.0).