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データベース:

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 +方向のみ検索 -方向のみ検索

2025-04-03 12:45:16, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

Cinclus cinclus genome assembly, chromosome: 1.
OY759677.1:114619335-114619354
TAGTACTCCTAGAAGGATTACATCTCCTTT114619335AGGTCTCTATGCACCTTTGCTAATATTAGTAAAACTCTTTTTCATGAGTT
TSA: Cannabis sativa PK21994.1_1.CasaPuKu mRNA sequence.
JP449881.1:1057-1076
ATGGAGGGGAAGCAAGGGGTTAGGCTCATG1057AGGTCTCTATGCACCTTTGCGTATAACATGGCTAGGGATGACGGTGGATG

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/AGGTCTCTATGCACCTTTGC
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : AGGTCTCTATGCACCTTTGC | format : html | download : | debug :

0.009 | 0.009 | search_start;
0.175 | 0.166 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=AGGTCTCTATGCACCTTTGC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.266 | 0.091 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GCAAAGGTGCATAGAGACCT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.266 | 0.000 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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