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データベース:

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 +方向のみ検索 -方向のみ検索

2025-04-03 15:49:14, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

Furcifer pardalis isolate Fpa_1 chromosome 9.
CP126898.1:9138934-9138953
GTTGGTCTTGCTCAGAGCTTTAGCAGGTGC9138934AGGTTTGGTGGAGAAGTGTTGTAGGCACTGGTGGCATATCAAACCTCCAT
Elaeis guineensis EST, clone (6lib)_isotig30519.
LM624875.1:974-993
TATCATGGCAATCTTGCCAGCAAGCCTCCC974AGGTTTGGTGGAGAAGTGTTGCTGCTGCCGGCTCATAGTGCGTGCGACCT
Sarcophaga variegata genome assembly, chromosome: 3.
OW026360.1:21485685-21485704
GCCTACAGTTTAACGTTGGCTGTCAACCAT21485685AGGTTTGGTGGAGAAGTGTTTATGGAAATTTTATTTATTCTCTTAGTTTT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/AGGTTTGGTGGAGAAGTGTT
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : AGGTTTGGTGGAGAAGTGTT | format : html | download : | debug :

0.009 | 0.009 | search_start;
0.263 | 0.254 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=AGGTTTGGTGGAGAAGTGTT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.322 | 0.060 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=AACACTTCTCCACCAAACCT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=47
0.322 | 0.000 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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