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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-03 11:50:47, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Furcifer pardalis isolate Fpa_1 chromosome 2.
CP126891.1:57891032-57891051
CAAGGGCTGAGGAGGGAGTTTCGAGCTCCC57891032AGTCCCAAGTGGACACCAAGAGCGCTTCACGAGGGGATTCCCCTAATGCT
Arachis hypogaea DNA, clone: NYHA00A27, cultivar: Nakateyutaka.
DE998916.1:90-109
TCTCGTCAAGATAACAATTTAGTGAAGACC90AGTCCCAAGTGGACACCAAGGTAGCTTCACCACAAGTCTCTAATGAAGTA
Arachis hypogaea cultivar Shitouqi chromosome B01.
CP030993.1:10909150-10909169
TCTCGTCAAGATAACAATTTAGTGAAGACC10909150AGTCCCAAGTGGACACCAAGGTAGCTTCACCACAAGTCTCTAATGAAGTA
Arachis ipaensis cultivar K30076 chromosome 01.
CP049892.1:10991790-10991809
TCTCGTCAAGATAACAATTTAGTGAAGACC10991790AGTCCCAAGTGGACACCAAGGTAGCTTCACCACAAGTCTCTAATGAAGTA
Furcifer pardalis isolate Fpa_1 chromosome 6.
CP126895.1:45999505-45999524
AGCATTAGGGGAATCCCCTCTTGAAGCGCT45999505CTTGGTGTCCACTTGGGACTGGGAGCTCGAAACTCCCTCCTCAGCCCTTG

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/AGTCCCAAGTGGACACCAAG
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : AGTCCCAAGTGGACACCAAG | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.319 | 0.310 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=AGTCCCAAGTGGACACCAAG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.397 | 0.078 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CTTGGTGTCCACTTGGGACT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=46
0.398 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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