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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-09 18:27:32, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Bufo bufo genome assembly, chromosome: 2.
LR991668.1:332790952-332790971
TTTAACTCCCTCTGCCGCAGCTATGCCAAA332790952ATAAATTGCTGCAGGTTGGGAACCTGCACAGCACACCGTCCGAAGACAGC
Accipiter gentilis genome assembly, chromosome: 17.
OV839378.1:5116043-5116062
TGTAGGTACAAACCCTGCCTGTGTCTTCAA5116043ATAAATTGCTGCAGGTTGGGGCTCTGGAGGTGCCCAGCCTCTTCCTTGAG
Haliaeetus albicilla genome assembly, chromosome: 16.
OX381653.1:5248320-5248339
TGTAGGTACGAACCCTGCCTGTGTCTTCAA5248320ATAAATTGCTGCAGGTTGGGGCTCTGGAGGTGCCCAGCCTCTTCCTTGAG
Triglochin maritima genome assembly, chromosome: 9.
OY821778.1:1508544-1508563
AAACTAATGATTCTCATTTATGGCGTTTAA1508544ATAAATTGCTGCAGGTTGGGAGGGACATGGGCGAAGCGACCACTTTTGCC
Porphyra yezoensis cDNA clone:PM032c11_r, 5' end.
AV433675.1:346-365
GCGGCAAACCAGGCGGCCATGGCCAACAAC346CCCAACCTGCAGCAATTTATGCGGCTACAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCA
Dioctria rufipes genome assembly, chromosome: 3.
OZ002742.1:179800043-179800062
TTTCGAATGAAGTGCACTACAATTTAATCA179800043CCCAACCTGCAGCAATTTATAAATAAATAATAAATAAATTTTCATTAGAA

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/ATAAATTGCTGCAGGTTGGG
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : ATAAATTGCTGCAGGTTGGG | format : html | download : | debug : 

0.008 | 0.008 | search_start;
0.375 | 0.367 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=ATAAATTGCTGCAGGTTGGG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.488 | 0.113 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CCCAACCTGCAGCAATTTAT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=46
0.489 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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