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データベース:

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
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2026-02-07 15:03:12, GGGenome : DDBJ release 138.0 (Jun, 2025)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

Musa acuminata subsp. burmannicoides genome assembly, chromosome: 2.
OZ193587.1:26441898-26441917
ATTAGAACATTCAATTCAGGATTATCTGAA26441898TCGTGGCTCTTTTGGGATATAGGTAACTATTTGGTACATGGAAGATATCT
Lepidonotus clava genome assembly, chromosome: 15.
OW387147.1:27944255-27944274
CCAATTTTAAAATGATAAATGTTACATCAA27944255TCGTGGCTCTTTTGGGATATACATTCACATCACCAAATTATTCACAAAGG

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/ATATCCCAAAAGAGCCACGA
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : ATATCCCAAAAGAGCCACGA | format : html | download : | debug :

0.009 | 0.009 | search_start;
0.110 | 0.101 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50800/match?q=ATATCCCAAAAGAGCCACGA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.140 | 0.030 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50800/match?q=TCGTGGCTCTTTTGGGATAT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.142 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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