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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
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2025-04-05 18:54:14, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

TSA: Cajanus cajan cultivar UPAS 120 contig12581.UPAS mRNA sequence.
EZ630298.1:69-90
CTCCACCGGTATTTCCACACGCTCAATTTC69ATATCTTCCCTACGTGTGTGTCTCTGTCTCTGTCTCTCTCTATACTATAAAA
TSA: Cajanus cajan cultivar Asha contig34032.Asha mRNA sequence.
EZ681896.1:916-937
TTTTATAGTATAGAGAGAGACAGAGACAGA916GACACACACGTAGGGAAGATATGAAATTGAGCGTGTGGAAATACCGGGGGAG
Sepiola atlantica genome assembly, chromosome: 7.
OY744521.1:68621868-68621889
ATAGTACTTATAGAAGAGACTGAGACTAGC68621868GACACACACGTAGGGAAGATATGCACAACACACCAGCTACTAACAAGCATAG

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/ATATCTTCCCTACGTGTGTGTC
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : ATATCTTCCCTACGTGTGTGTC | format : html | download : | debug :

0.009 | 0.009 | search_start;
0.363 | 0.355 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=ATATCTTCCCTACGTGTGTGTC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.477 | 0.114 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GACACACACGTAGGGAAGATAT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=49
0.479 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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