GGGenome Help | English

データベース：
 

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-03 12:06:11, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Onychomys arenicola genome assembly, chromosome: 8.
OX460449.1:90259186-90259205
CAAGATTTAGGACAACGACCCTTTAAGACA90259186ATCACCTTGGATGGCAAGAGCTTCCAAGGACTCTTGGACACAGGTGCTGA
Porphyra yezoensis DNA, microsatellite Pye41.
AB191330.1:23-42
CCGACCGACCTCGTCATGATCC23ATCACCTTGGATGGCAAGAGTCCTTTGGTGCGGTGGTGGGAAGCACCTCC
Onychomys arenicola genome assembly, chromosome: 14.
OX460360.1:91337953-91337972
TCAGCACCTGTGTCCAAGAGTCCTTGGAAG91337953CTCTTGCCATCCAAGGTGATTGTCTTAAAGGGTCGTTGTCCTAAATCTTG
Onychomys arenicola genome assembly, chromosome: 14.
OX460455.1:87652787-87652806
TCAGCACCTGTGTCCAAGAGTCCTTGGAAG87652787CTCTTGCCATCCAAGGTGATTGTCTTAAAGGGTCGTTGTCCTAAATCTTG
Rhinatrema bivittatum genome assembly, chromosome: 2.
LR584388.1:376903832-376903851
GCAGTGCGATCTAAATAGAAAGCCAATGCC376903832CTCTTGCCATCCAAGGTGATGAGCCTGATCCCCTCGGTGGGAATGAGGCA

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/ATCACCTTGGATGGCAAGAG
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : ATCACCTTGGATGGCAAGAG | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.162 | 0.153 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=ATCACCTTGGATGGCAAGAG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.269 | 0.107 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CTCTTGCCATCCAAGGTGAT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.272 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
This page is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License (CC BY 4.0).