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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-03 15:28:05, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Sequence 8218 from patent US 9481889.
KH326337.1:1054950-1054973
CATCTTGATCAGTGGACTGACGTCGATCAA1054950TAGCGAGAGGTTCCACATCGTGATCGATGGCTGCCAGGTGGTGACGGTGCACGG
Sequence 8218 from patent US 10633715.
MV130452.1:1054950-1054973
CATCTTGATCAGTGGACTGACGTCGATCAA1054950TAGCGAGAGGTTCCACATCGTGATCGATGGCTGCCAGGTGGTGACGGTGCACGG
Sequence 27 from patent US 10905061.
MX343390.1:1054950-1054973
CATCTTGATCAGTGGACTGACGTCGATCAA1054950TAGCGAGAGGTTCCACATCGTGATCGATGGCTGCCAGGTGGTGACGGTGCACGG
Sequence 8218 from patent US 11371104.
OO311973.1:1054950-1054973
CATCTTGATCAGTGGACTGACGTCGATCAA1054950TAGCGAGAGGTTCCACATCGTGATCGATGGCTGCCAGGTGGTGACGGTGCACGG
Elaeis guineensis fruit ripening and abscission polygalacturonase (PG4) mRNA, complete cds.
JX233616.2:589-612
CATCTTGATCAGTGGACTGACGTCGATCAA589TAGCGAGAGGTTCCACATCGTGATCGATGGCTGCCAGGTGGTGACGGTGCACGG
Elaeis guineensis polygalacturonase (PEC) mRNA, complete cds.
KC146055.1:543-566
CATCTTGATCAGTGGACTGACGTCGATCAA543TAGCGAGAGGTTCCACATCGTGATCGATGGCTGCCAGGTGGTGACGGTGCACGG

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/ATCACGATGTGGAACCTCTCGCTA
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : ATCACGATGTGGAACCTCTCGCTA | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.154 | 0.145 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=ATCACGATGTGGAACCTCTCGCTA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.447 | 0.293 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TAGCGAGAGGTTCCACATCGTGAT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.451 | 0.004 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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