GGGenome Help | English

データベース：
 

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-03 15:34:09, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Daucus carota subsp. sativus cultivar DH1 chromosome 4.
CP093346.1:44685308-44685327
GAATTCATGGTACTGGGGAATTTACGGTAC44685308ATCAGGTCGTATTGGCGTGCTACTCTTTAAAGTCACATTAGGCTGGCCTT
Daucus carota isolate Kuroda chromosome 4.
CP125304.1:32974302-32974321
GAATTCATGGTACTGGGGAATTTACGGTAC32974302ATCAGGTCGTATTGGCGTGCTACTCTTTAAAGTCACATTAGGCTGGCCTT
Bradyrhizobium brasilense strain CB627 chromosome, complete genome.
CP121646.1:319319-319338
GGTTCTGCCGCGCCCATCTCGGCGAGGGCG319319ATCAGGTCGTATTGGCGTGCCTGAAGGAGCATCGCAGCCGCCTCAGCAAG

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/ATCAGGTCGTATTGGCGTGC
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : ATCAGGTCGTATTGGCGTGC | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.171 | 0.162 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=ATCAGGTCGTATTGGCGTGC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.248 | 0.078 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GCACGCCAATACGACCTGAT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=47
0.248 | 0.000 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
This page is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License (CC BY 4.0).