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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-03-14 19:19:31, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

RS2BZ42JQ RS2(RS) Raphanus sativus cDNA 3', mRNA sequence.
EX899866.1:421-442
GTACCCCGGGAAAAAAGGTTGTCATATCTT421ATCCTCTTCATTGGTTCGGGTATTAATAGTATCCGATCTGATCTGCGAAGGA
Raphanus sativus genome assembly, chromosome: 1.
LR778310.1:13586895-13586916
GTACCCCGGGAAAAAAGGTTGTCATATCTT13586895ATCCTCTTCATTGGTTCGGGTATTAATAGTATCCGATCTGATCTGCGAAGGA
Raphanus sativus genome assembly, chromosome: 6.
OY743212.1:13586895-13586916
GTACCCCGGGAAAAAAGGTTGTCATATCTT13586895ATCCTCTTCATTGGTTCGGGTATTAATAGTATCCGATCTGATCTGCGAAGGA
RS2BZ42TF RS2(RS) Raphanus sativus cDNA 5', mRNA sequence.
EX895847.1:560-581
TCCTTCGCAGATCAGATCGGATACTATTAA560TACCCGAACCAATGAAGAGGATAAGATATGACAACCTTTTTTCCCGGGGTAC

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/ATCCTCTTCATTGGTTCGGGTA
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : ATCCTCTTCATTGGTTCGGGTA | format : html | download : | debug : 

0.008 | 0.008 | search_start;
0.338 | 0.330 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=ATCCTCTTCATTGGTTCGGGTA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.518 | 0.180 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TACCCGAACCAATGAAGAGGAT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=47
0.519 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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