GGGenome Help | English

データベース：
 

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-03-14 19:17:42, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

RS1AD26JQ RS1(AR) Raphanus sativus var. oleiformis cDNA 3', mRNA sequence.
EW719699.1:91-112
TGTTATCTCTTCCGGTAGTCTTCTCACAGG91ATCCTGCAATTAGGTTCGTGGTTGTAGACTGGTTCCCCGATATAGTCCCTAG
RS2BD62JQ RS2(RS) Raphanus sativus cDNA 3', mRNA sequence.
EW730543.1:154-175
TGTTCTCTCTTCCGGTAGTCTTCTTACAGG154ATCCTGCAATTAGGTTCGTGGTTGTAGACTGGTTCCCCGATATAGTCCCTAG
Raphanus sativus genome assembly, chromosome: 1.
LR778310.1:1763396-1763417
TGCTTTCTCTTCCGGTAGTCTTCTCACATG1763396ATCCTGCAATTAGGTTCGTGGTTGTAGACGGGTTCACCGATGTAATCCCTAG
Raphanus sativus genome assembly, chromosome: 6.
OY743212.1:1763396-1763417
TGCTTTCTCTTCCGGTAGTCTTCTCACATG1763396ATCCTGCAATTAGGTTCGTGGTTGTAGACGGGTTCACCGATGTAATCCCTAG
RS1AD26TF RS1(AR) Raphanus sativus var. oleiformis cDNA 5', mRNA sequence.
EW715054.1:595-616
CTAGGGACTATATCGGGGAACCAGTCTACA595ACCACGAACCTAATTGCAGGATCCTGTGAGAAGACTACCGGAAGAGATAACA

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/ATCCTGCAATTAGGTTCGTGGT
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : ATCCTGCAATTAGGTTCGTGGT | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.349 | 0.340 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=ATCCTGCAATTAGGTTCGTGGT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.524 | 0.175 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=ACCACGAACCTAATTGCAGGAT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=46
0.525 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
This page is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License (CC BY 4.0).