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2025-04-03 11:47:58, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

Arachis hypogaea cultivar Shitouqi chromosome A02.
CP030984.1:93453815-93453834
GTAGTGAGGACAACGTGCAACGACGGCGAC93453815ATCGGAAGTTCCAAGTGGTGGTGGCGACGGCGGTAGCTTTAACGGATGAG
Mythimna vitellina genome assembly, chromosome: 17.
OX438701.1:131671-131690
GAAGGACAATGCAGTCTTCACCAGACATTG131671ATCGGAAGTTCCAAGTGGTGAGGAAACTCTACATTACATATGTCCGGATC
Mythimna lalbum genome assembly, chromosome: 14.
OX439358.1:3434897-3434916
CTTTATGGGGCGCCGTCGCTGGCGACCGTG3434897ATCGGAAGTTCCAAGTGGTGAAGAAACTATTACGATACATCTGTCCGGAT
Arachis hypogaea DNA, clone: AHGS47J21.
DH961655.1:393-412
CTCATCCGTTAAAGCTACCGCCGTCGCCAC393CACCACTTGGAACTTCCGATGTCGCCGTCGTTGCACGTTGTCCTCACTAC
Mythimna pallens genome assembly, chromosome: Z.
OY540824.1:27933823-27933842
ATCCGGACAGATGTATCGTAACAGTTTCTT27933823CACCACTTGGAACTTCCGATCACTGTCTGGTGAAGCCTGTATCGTCCTTC

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/ATCGGAAGTTCCAAGTGGTG
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : ATCGGAAGTTCCAAGTGGTG | format : html | download : | debug :

0.009 | 0.009 | search_start;
0.318 | 0.309 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=ATCGGAAGTTCCAAGTGGTG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.424 | 0.107 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CACCACTTGGAACTTCCGAT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=47
0.426 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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