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データベース：
 

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-09 21:10:00, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Lotus japonicus genomic DNA, chromosome 4, clone: LjT07K08, TM0046b.
AP004519.1:20316-20335
GGAAAAATAAAAGCAATTTTCCCCTTAAAA20316ATCTAACCAAAACGTGCTTCTTATCCTCTCATAATTTTCACTTCCTTTCT
Lotus japonicus genomic DNA, chromosome 4, clone: LjT41M05, TM0404.
AP006697.1:43121-43140
GGAAAAATAAAAGCAATTTTCCCCTTAAAA43121ATCTAACCAAAACGTGCTTCTTATCCTCTCATAATTTTCACTTCCTTTCT
Lotus japonicus genomic DNA, chromosome 5, clone: LjT30D08, TM0551.
AP007427.2:57878-57897
AGAAAGGAAGTGAAAATTATGAGAGGATAA57878GAAGCACGTTTTGGTTAGATTTTTAAGGGGAAAATTGCTTTTATTTTTCC
Lotus japonicus B-129 DNA, chromosome 4, complete sequence.
AP022632.1:76121870-76121889
AGAAAGGAAGTGAAAATTATGAGAGGATAA76121870GAAGCACGTTTTGGTTAGATTTTTAAGGGGAAAATTGCTTTTATTTTTCC
Cheilosia vernalis genome assembly, chromosome: 3.
OX421360.1:16831212-16831231
ATCTCATTAAAACAATGTGCATTTCCACAG16831212GAAGCACGTTTTGGTTAGATGTACATATATGTATATAAAACTTTAAAAAA

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/ATCTAACCAAAACGTGCTTC
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : ATCTAACCAAAACGTGCTTC | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.321 | 0.312 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=ATCTAACCAAAACGTGCTTC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.414 | 0.093 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GAAGCACGTTTTGGTTAGAT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.417 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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