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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-15 17:11:00, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Mobula hypostoma genome assembly, chromosome: 24.
OY992616.1:37351595-37351614
AAGCCATTCAACCATCCAGTTGCTGAACCA37351595ATCTTCACAACCCTAATGTCTACCTCAGTATAGTAACACTATGGCTGCTT
Prunus dulcis DNA, pseudomolecule Pd05.
AP019301.1:11579387-11579406
AGTTTGTAACTTTGTATCATTCTGTGTTTT11579387ATCTTCACAACCCTAATGTCCCATTTTGGCGCATTTGATCCCGTGACAAG
P.persica ppEG1 gene.
X96856.1:1618-1637
AGTTTGTAACTTTGTATCATTCTGTGTTTT1618ATCTTCACAACCCTAATGTCCCATTTTGGCGCATTTGATCCCGTGACAAG
Sympetrum striolatum genome assembly, chromosome: 8.
OX388348.1:34693081-34693100
TCTTTCAGGGACTGTCTTCATGAAAAAAAA34693081ATCTTCACAACCCTAATGTCCTAATGCACCAGTTAAACATATTTAAATGA
Muntiacus reevesi genome assembly, chromosome: 3.
OZ005626.1:240458179-240458198
TTTGGGGTACTCCTCTCTACCTGCCTTCCA240458179GACATTAGGGTTGTGAAGATGAGCAGCTTATAACCACCAAATTTGTTTTA
Accipiter gentilis genome assembly, chromosome: 31.
OV839392.1:14648620-14648639
ATGACTGTTTTTCATCTATCGGTAAATGAT14648620GACATTAGGGTTGTGAAGATTTTCTGTCCTGTTCAAATATGAGGAATGTT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/ATCTTCACAACCCTAATGTC
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : ATCTTCACAACCCTAATGTC | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.190 | 0.181 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=ATCTTCACAACCCTAATGTC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.299 | 0.109 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GACATTAGGGTTGTGAAGAT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=46
0.301 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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