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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2026-03-05 18:50:25, GGGenome : DDBJ release 139.0 (Sep, 2025)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Meles meles genome assembly, chromosome: 5.
OV277445.1:89014822-89014841
GTCCCCTTGTCACATGCCGCCCCGGTAAGG89014822GGAGTGGACTGTGGCTTCATCCGTCCCAGTGGGTTCCCAGGGACTTTGAT
atr01-10ms1-b07 Atr01 Amborella trichopoda cDNA clone atr01-10ms1-b07 5', mRNA sequence.
CD482303.2:477-496
GACACAACTTGAATTATGAGGGAAATAATT477GGAGTGGACTGTGGCTTCATTTATCCCTACAATTCCCAACAAGGACCAGT
Cidaria fulvata genome assembly, chromosome: 9.
OZ203752.1:1786559-1786578
GCTAGCGACATCTCTGTTCAGCAAAGGTCG1786559GGAGTGGACTGTGGCTTCATTGTCGTGCAGCCAGTTGATGATCTCGCTAA
Poecilia reticulata strain Guanapo & Maculatus chromosome 9.
CP158537.1:18018954-18018973
GCGACCACAAACATCAGGTTTCTGCTCAGT18018954GGAGTGGACTGTGGCTTCATGAAGACAAGGAGTTATGATTCACCTCTGAC
Poecilia reticulata strain Guanapo & Maculatus chromosome 9.
CP158560.1:18018954-18018973
GCGACCACAAACATCAGGTTTCTGCTCAGT18018954GGAGTGGACTGTGGCTTCATGAAGACAAGGAGTTATGATTCACCTCTGAC
Poecilia reticulata genome assembly, chromosome: 9.
LR880653.2:17707854-17707873
GTGACCACAAACATCAGGTTTCTGCTCAGT17707854GGAGTGGACTGTGGCTTCATGAAGACAAGGAGTTATGATTCACCTCTGAC

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/ATGAAGCCACAGTCCACTCC
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : ATGAAGCCACAGTCCACTCC | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.376 | 0.367 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50900/match?q=ATGAAGCCACAGTCCACTCC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.730 | 0.354 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50900/match?q=GGAGTGGACTGTGGCTTCAT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.735 | 0.004 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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