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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
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2025-04-03 12:24:41, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

CGN-38681 Seed of Late Development Stage Coffea canephora cDNA clone cccs46w3c15 5', mRNA sequence.
DV694253.1:547-571
AGCAGCAGACGCAAAGGCAAGGCTACCGAA547TGAGGAGGAAGTGTTAAAATGGCATTAGGTGCTAAGTAGAATGTGTTACTTTCTT
CGN-50223 Seed of Late Development Stage Coffea canephora cDNA clone cccs46w30h24 5', mRNA sequence.
DV703622.1:534-558
AGCAGCAGACGCAAAGGCAAGGCTACCGAA534TGAGGAGGAAGTGTTAAAATGGCATTAGGTGCTAAGTAGAATGTGTTACTTTCTT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/ATGCCATTTTAACACTTCCTCCTCA
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : ATGCCATTTTAACACTTCCTCCTCA | format : html | download : | debug :

0.009 | 0.009 | search_start;
0.169 | 0.160 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=ATGCCATTTTAACACTTCCTCCTCA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.376 | 0.207 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TGAGGAGGAAGTGTTAAAATGGCAT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.378 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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