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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2026-03-05 14:43:59, GGGenome : DDBJ release 139.0 (Sep, 2025)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Elaeis guineensis EST, clone (6lib)_isotig00927.
LM615788.1:1999-2022
TGTACCAGGGTGCTGGTGCTGATGTGGCTG1999GTGGCATGGATGAAGATGGTCCATCAGCTGGTGGTAGTGGTGCTGGTCCCACAA
TSA: Elaeis guineensis isotig09592.Elguifruit mRNA sequence.
JO096819.1:1835-1858
TGTACCAGGGTGCTGGTGCTGATGTGGCTG1835GTGGCATGGATGAAGATGGTCCATCAGCTGGTGGTAGTGGTGCTGGTCCCACAA
Elaeis guineensis clone estEgSNP7 DnaK-type molecular chaperone hsp70 (Hsp70) mRNA, partial cds.
JX438709.1:355-378
TGTACCAGGGTGCTGGTGCTGATGTGGCTG355GTGGCATGGATGAAGATGGTCCATCAGCTGGTGGTAGTGGTGCTGGTCCCACAA
Areca catechu clone 1632b heat shock cognate 70 kDa protein 2-like (HSP70) mRNA, complete cds.
PQ999205.1:1562-1585
TGTACCAGGGTGCTGGTGCTGATATGGCTG1562GTGGCATGGATGAAGATGGTCCATCAGCTGGTGGTAGTGGTGCTGGTCCCAAAA

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/ATGGACCATCTTCATCCATGCCAC
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : ATGGACCATCTTCATCCATGCCAC | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.328 | 0.319 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50900/match?q=ATGGACCATCTTCATCCATGCCAC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.604 | 0.276 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50900/match?q=GTGGCATGGATGAAGATGGTCCAT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.607 | 0.003 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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