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データベース：
 

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-12 12:50:37, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

BOICS16TF BO_1.4_1.6_KB_nuc Brassica oleracea genomic clone BOICS16, genomic survey sequence.
CC951590.1:329-354
GCATGTCTGTATGAAGATAAAGAGTTAGAA329ATGGGATTTACCAAAACCACCAGTGCTCACATAACCTTGCCCAAAGACACGCTCAT
lky33g07.b1 B.oleracea002 Brassica oleracea genomic, genomic survey sequence.
BZ061756.1:390-415
ATGAGCGTGTCTTTGGGCAAGGTTATGTGA390GCACTGGTGGTTTTGGTAAATCCCATTTCTAACTCTTTATCTTCATACAGACATGC
Brassica napus cultivar Xiang5A chromosome 12.
CP123887.1:7267331-7267356
ATGAGCGTGTCTTTGGGCAAGGTTATGTGA7267331GCACTGGTGGTTTTGGTAAATCCCATTTCTAACTCTTTATCTTCATACAGACATGC
Brassica oleracea HDEM genome, scaffold: C6.
LR031880.1:3594250-3594275
ATGAGCGTGTCTTTGGGCAAGGTTATGTGA3594250GCACTGGTGGTTTTGGTAAATCCCATTTCTAACTCTTTATCTTCATACAGACATGC

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/ATGGGATTTACCAAAACCACCAGTGC
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : ATGGGATTTACCAAAACCACCAGTGC | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.266 | 0.256 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=ATGGGATTTACCAAAACCACCAGTGC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.372 | 0.107 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GCACTGGTGGTTTTGGTAAATCCCAT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=49
0.374 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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