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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 +方向のみ検索 -方向のみ検索

2025-04-05 21:03:51, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

WS03216.C21_M01 WS-MC-N-A-20 Picea glauca cDNA clone WS03216_M01 3, mRNA sequence.
DR549892.1:623-642
GACTCGTCGGCGACCACGTCGTTCTGCGGA623ATGTATACAGAATATCCCCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCCTCCTCCCC
Sepia lycidas genome assembly, chromosome: 25.
OZ010595.1:20474935-20474954
CTCTCTCTATATATATATATATATATATAT20474935ATGTATACAGAATATCCCCCAAAATGTACTCCCTTTTTGACTTCTTATAA

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/ATGTATACAGAATATCCCCC
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : ATGTATACAGAATATCCCCC | format : html | download : | debug :

0.008 | 0.008 | search_start;
0.402 | 0.393 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=ATGTATACAGAATATCCCCC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.516 | 0.115 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GGGGGATATTCTGTATACAT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.516 | 0.000 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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