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データベース:

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
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2025-04-03 14:34:31, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

Capsicum annuum cultivar G1-36576 isolate CaT2T chromosome 10.
CP124722.1:168443426-168443445
CTTCTTAAATCAAGACGGGTCAAATTCAGG168443426ATGTTAGCAATTGAATCCGGCAGAGAACCGGTGAATCCCGTGTGGCTAAG
Capsicum annuum Takanotsume DNA, chromosome 10, sequence.
AP026705.1:147620923-147620942
CTTAGCCACACGGGATTCACCGGTTCTCTG147620923CCGGATTCAATTGCTAACATCCTGAATTTGACCCGTCTTGATTTAAGAAG

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/ATGTTAGCAATTGAATCCGG
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : ATGTTAGCAATTGAATCCGG | format : html | download : | debug :

0.009 | 0.009 | search_start;
0.174 | 0.165 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=ATGTTAGCAATTGAATCCGG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.267 | 0.093 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CCGGATTCAATTGCTAACAT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=49
0.268 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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