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データベース:

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 +方向のみ検索 -方向のみ検索

2025-04-03 15:01:14, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

Sequence 49137 from patent US 9012723.
HK612791.1:659-683
AGAAACTGATAGGTCTAAAGTCCATGATGG659ATGTTGGTGAATCTGATTTGGGGATGCGCACCACAACAGTTTCAGCTATCTGGGT
Glycine max strain Williams 82 clone GM_WBb0002N17, complete sequence.
AC235172.1:24439-24463
AGAAACTGATAGGTCTAAAGTCCATGATGG24439ATGTTGGTGAATCTGATTTGGGGATGCGCACCACAACAGTTTCAGCTATCTGGGT
Glycine max cultivar Williams 82 chromosome 11.
CP126436.1:9528338-9528362
ACCCAGATAGCTGAAACTGTTGTGGTGCGC9528338ATCCCCAAATCAGATTCACCAACATCCATCATGGACTTTAGACCTATCAGTTTCT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/ATGTTGGTGAATCTGATTTGGGGAT
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : ATGTTGGTGAATCTGATTTGGGGAT | format : html | download : | debug :

0.009 | 0.009 | search_start;
0.198 | 0.189 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=ATGTTGGTGAATCTGATTTGGGGAT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.288 | 0.091 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=ATCCCCAAATCAGATTCACCAACAT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.289 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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