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データベース：
 

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-03 12:10:55, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

KR 1020040013638-A/6: DNA Marker for the Clubroot Resistant Gene.
DI126037.1:1-20
1ATTACCGGAGTATGCGATCC
Brassica rapa genome, scaffold: A03.
LR031572.1:25553451-25553470
AAAATGGAACAAGAAAAGGATTAACGAGCT25553451ATTACCGGAGTATGCGATCCAAATCCAGGGGCTTCAGCCAAGCACAAAGG
Brassica rapa genome assembly, chromosome: A03.
LS974619.2:25681389-25681408
AAAATGGAACAAGAAAAGGATTAACGAGCT25681389ATTACCGGAGTATGCGATCCAAATCCAGGGGCTTCAGCCAAGCACAAAGG
Pyrrhosoma nymphula genome assembly, chromosome: 3.
OY754329.1:83682499-83682518
GTTAGGAATGAGTGGGTGATGGAAGAATTT83682499GGATCGCATACTCCGGTAATGGACATAAACAAAAGGAGTGTGCTTTGTTG

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/ATTACCGGAGTATGCGATCC
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : ATTACCGGAGTATGCGATCC | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.232 | 0.223 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=ATTACCGGAGTATGCGATCC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.323 | 0.091 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GGATCGCATACTCCGGTAAT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=47
0.324 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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