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データベース:

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 +方向のみ検索 -方向のみ検索

2026-03-05 07:55:17, GGGenome : DDBJ release 139.0 (Sep, 2025)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

TSA: Cannabis sativa PK28570.1_1.CasaPuKu mRNA sequence.
JP449652.1:69-88
GTACAGCTTTCTTAAATATGGTGAGATGAG69ATTAGCTATTCCAACACGGGGCCCTCCCCCTGTCCCTGTCCCTGTCCCTG
Cannabis sativa cultivar ERBxHO40_23 chromosome X.
CP158662.1:139908-139927
GTACAGCTTTCTTAAATATGGTGAGATGAG139908ATTAGCTATTCCAACACGGGGCCCTCCCCCTGTCCCTGTCCCTGTCCATT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/ATTAGCTATTCCAACACGGG
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : ATTAGCTATTCCAACACGGG | format : html | download : | debug :

0.009 | 0.009 | search_start;
0.781 | 0.771 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50900/match?q=ATTAGCTATTCCAACACGGG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
1.584 | 0.804 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50900/match?q=CCCGTGTTGGAATAGCTAAT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
1.584 | 0.000 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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