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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-03 08:52:45, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Daucus carota subsp. sativus cultivar DH1 chromosome 4.
CP093346.1:44718961-44718980
CTCTCCCAAAATCGGCTTCATTGCTTCTGT44718961GGCTTCCAGTCCGTGATAATGGGGAATCATGGAGAAAATGTGGTGACAGA
Daucus carota isolate Kuroda chromosome 4.
CP125304.1:33008826-33008845
CTCTCCCAAAATCGGCTTCATTGCTTCTGT33008826GGCTTCCAGTCCGTGATAATGGGGAATCATGGAGAAAATGTGGTGACAGA
Sphingopyxis indica strain MC4 chromosome, complete genome.
CP076394.1:1341622-1341641
GCCATCGGTAGAGGCACCAACGCGGGCCTT1341622GGCTTCCAGTCCGTGATAATCGCGCTTCAGCCGAATGTTGACGACGCCGG

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/ATTATCACGGACTGGAAGCC
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : ATTATCACGGACTGGAAGCC | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.340 | 0.331 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=ATTATCACGGACTGGAAGCC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.444 | 0.104 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GGCTTCCAGTCCGTGATAAT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.446 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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