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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-03-15 15:00:58, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Ferdinandea cuprea genome assembly, chromosome: 5.
OY754962.1:22951328-22951347
GGCCGAGGTTTTAACAACACTTTACTATTA22951328ATTATCGTTGCTCGCTGCTTTTTGGACATTTCCTTAGCCATCGGCCCGGG
MAG: Idiomarina sp. isolate HT2 chromosome.
CP080268.1:395180-395199
GCTCAATACCAATCATCAGGCCAATAGCCA395180AAGCAGCGAGCAACGATAATGCCAGCTCCAACTGATAGTGCATGGTTTGT
Trifolium repens mRNA, clone: WCC18m09_039, unspecified EST.
FY460515.1:236-255
TAACTAACTAATTATACTATACTATGGTGA236AAGCAGCGAGCAACGATAATGGTTCTGTTTCTTCTTCTGTTGCACCTTTC
Trifolium repens isolate ACLI19 chromosome 04_Pall.
CP125843.1:59039768-59039787
TAACTAACTAATTATACTATACTATGGTGA59039768AAGCAGCGAGCAACGATAATGGTTCTGTTTCTTCTTCTGTTGCACCTTTC

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/ATTATCGTTGCTCGCTGCTT
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : ATTATCGTTGCTCGCTGCTT | format : html | download : | debug : 

0.008 | 0.008 | search_start;
0.100 | 0.091 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=ATTATCGTTGCTCGCTGCTT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.217 | 0.117 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=AAGCAGCGAGCAACGATAAT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=49
0.219 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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