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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 +方向のみ検索 -方向のみ検索

2025-04-03 19:48:47, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

Brassica napus cultivar Xiang5A chromosome 14.
CP123889.1:16120739-16120758
CTCTCTCAGATTGTTTCTGTTAATCAATCT16120739GCCTTTGTGGAGGATAGAATCATCTTTGATAATATTATGATCGCGCATGA
Brassica napus genome assembly, chromosome: A04.
HG994358.1:10640315-10640334
CTCTCTCAGATTGTTTCTGTTAATCAATCT10640315GCCTTTGTGGAGGATAGAATCATCTTTGATAATATTATGATCGCGCATGA
Bacteroides xylanisolvens XB1A draft genome.
FP929033.1:3319504-3319523
CTTATTAGAGATAGATATACCAAACATTTA3319504GCCTTTGTGGAGGATAGAATCAGACAAGGAAAGGATGTGAAGTATGTCAA

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/ATTCTATCCTCCACAAAGGC
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : ATTCTATCCTCCACAAAGGC | format : html | download : | debug :

0.009 | 0.009 | search_start;
0.172 | 0.163 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=ATTCTATCCTCCACAAAGGC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.272 | 0.100 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GCCTTTGTGGAGGATAGAAT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.274 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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