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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-03 11:41:55, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Scophthalmus maximus chromosome 2.
CP026244.1:19572166-19572185
AACGACTGTCAGGATACACCACCACAGACA19572166GAATGCACCTCGAATTAAATCAGCACTTCTCCATCAGCAATAACTGAATA
Scophthalmus maximus genome assembly, chromosome: 13.
OY978264.1:20871112-20871131
AACGACTGTCAGGATACACCACCACAGACA20871112GAATGCACCTCGAATTAAATCAGCACTTCTCCATCAGCAATAACTGAATA
Schizotus pectinicornis genome assembly, chromosome: 5.
OX638206.1:3294979-3294998
TCCCTTCCCGGTAAAAAACAAATTATACAA3294979GAATGCACCTCGAATTAAATGGAAAATATTGCATAAATATTTCCCTATTA

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/ATTTAATTCGAGGTGCATTC
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : ATTTAATTCGAGGTGCATTC | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.166 | 0.157 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=ATTTAATTCGAGGTGCATTC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.260 | 0.094 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GAATGCACCTCGAATTAAAT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.262 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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