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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 +方向のみ検索 -方向のみ検索

2025-04-11 20:46:46, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

Lotus japonicus B-129 DNA, chromosome 1, complete sequence.
AP022629.1:83557649-83557668
GGAAATTGGTAAAAGGAATGGAGTCAACTA83557649ATTTGTTGGGATACATTGACCAGTGTACAAATATGATACCTCATACGCAA
Lotus japonicus genomic DNA, chromosome 1, clone: LjT03J05, TM0050.
AP004523.1:39640-39659
TTGCGTATGAGGTATCATATTTGTACACTG39640GTCAATGTATCCCAACAAATTAGTTGACTCCATTCCTTTTACCAATTTCC
Siphonodentalium dalli isolate Sc116.8C chromosome VI.
CP136066.1:63281242-63281261
AATCGTCGGACATGGAAATTATGTTTTAGA63281242GTCAATGTATCCCAACAAATAAAAAGGAGGTTTTAGGTTTGTTTTGTCTA

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/ATTTGTTGGGATACATTGAC
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : ATTTGTTGGGATACATTGAC | format : html | download : | debug :

0.009 | 0.009 | search_start;
0.281 | 0.272 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=ATTTGTTGGGATACATTGAC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.356 | 0.075 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GTCAATGTATCCCAACAAAT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=49
0.357 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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