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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 +方向のみ検索 -方向のみ検索

2025-04-03 12:03:39, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

TSA: Cajanus cajan cultivar UPAS 120 contig05248.UPAS mRNA sequence.
EZ622965.1:301-320
AGCTCGCGCGTCGGGGCCAAAACTAACACA301ATAGGCCCATCTCCAGGTTCAAGAATTGGCTGGGCATTAACATGCACTAT
54-L026093.SEQ Pigeonpea genomic pBluescript library Cajanus cajan genomic 3', genomic survey sequence.
CZ445554.1:572-591
AGCTCGCGCGTCGGGGCCAAAACTAACACA572ATAGGCCCATCTCCAGGTTCTGTATAACACAGCAAAGGAATTAAAAGACA
TSA: Cajanus cajan cultivar Asha contig14922.Asha mRNA sequence.
EZ662786.1:514-533
ATAGTGCATGTTAATGCCCAGCCAATTCTT514GAACCTGGAGATGGGCCTATTGTGTTAGTTTTGGCCCCGAGCGCGAGCTT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/Ataggcccatctccaggttc
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : Ataggcccatctccaggttc | format : html | download : | debug :

0.009 | 0.009 | search_start;
0.364 | 0.356 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=ATAGGCCCATCTCCAGGTTC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.470 | 0.106 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GAACCTGGAGATGGGCCTAT&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.471 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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