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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-03 15:07:37, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Lotus japonicus genomic DNA, chromosome 6, clone: LjB12M17, BM1560.
AP010638.1:114744-114765
AATATGTATCAAATGTTAGTCATTTTTCAT114744GGCGTTAGCATAGTATAGTTTGAGGGTTGGGATTGCGGATTGTGATAATCTG
Lotus japonicus genomic DNA, chromosome 6, clone: LjT45B09, TM0885c.
AP006731.1:59343-59364
AATATGTATCAAATGTTAGTCATTTTTCAT59343GGCGTTAGCATAGTATAGTTTGAGGGTTGGGATTGCGGATTGTGATAATCTG
Lotus japonicus B-129 DNA, chromosome 6, complete sequence.
AP022634.1:67573060-67573081
AATATGTATCAAATGTTAGTCATTTTTCAT67573060GGCGTTAGCATAGTATAGTTTGAGGGTTGGGATTGCGGATTGTGATAATCTG

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/CAAACTATACTATGCTAACGCC
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : CAAACTATACTATGCTAACGCC | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.169 | 0.161 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CAAACTATACTATGCTAACGCC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.262 | 0.092 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GGCGTTAGCATAGTATAGTTTG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.264 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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