GGGenome Help | English

データベース：
 

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-03 11:24:44, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Malus hybrid cultivar cultivar Royalty chromosome 4.
CP141956.1:948489-948511
CAAAATATTCTTCTTTAGGGCAATTATTTT948489CAAATGTATACCAACTGAAAAGCTCAAGAGCCTCCTCTTCATTCATTTCCTTG
Malus sylvestris genome assembly, chromosome: 4.
OU696506.1:996637-996659
CAAAATATTCTTCTTTAGGGCAATTATTTT996637CAAATGTATACCAACTGAAAAGCTCAAGAGCCTCCTCTTCATTCATTTCCTTG
Malus x domestica NBS-LRR resistance gene-like protein ARGH23 gene, partial cds.
AY369221.1:411-433
CAAGGAAATGAATGAAGAGGAGGCTCTTGA411GCTTTTCAGTTGGTATACATTTGAAAATAATTGCCCTAAAGAAGAATATCTTG

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/CAAATGTATACCAACTGAAAAGC
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : CAAATGTATACCAACTGAAAAGC | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.104 | 0.095 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CAAATGTATACCAACTGAAAAGC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.129 | 0.024 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GCTTTTCAGTTGGTATACATTTG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=48
0.129 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
This page is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License (CC BY 4.0).