GGGenome Help | English

データベース：
 

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-03 11:24:45, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Arachis hypogaea cultivar Shitouqi chromosome A03.
CP030985.1:5324791-5324814
TAGATAAAATTAATTCTAAATTGAGAGATT5324791CAAATGTTTCAAGTTCTCTCCTCAATTAAATTTTGATTAGATCTAATTTTATAA
Arachis hypogaea cultivar Shitouqi chromosome B03.
CP030995.1:7479820-7479843
TAGATCAAATCAACTCCAAATTGAGAGATT7479820CAAATGTTTCAAGTTCTCTCCTCAATTAAATTTTGATTTAATCTAATTTTATAA
Arachis ipaensis cultivar K30076 chromosome 03.
CP049894.1:7424126-7424149
TAGATCAAATCAACTCCAAATTGAGAGATT7424126CAAATGTTTCAAGTTCTCTCCTCAATTAAATTTTGATTTAATCTAATTTTATAA
Arachis hypogaea DNA, clone: 8iHA04B15, cultivar: YI-0311.
DE998528.1:579-602
TTATAAAATTAGATCTAATCAAAATTTAAT579TGAGGAGAGAACTTGAAACATTTGAATCTCTCAATTTAGAATTAATTTTATCTA

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/CAAATGTTTCAAGTTCTCTCCTCA
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : CAAATGTTTCAAGTTCTCTCCTCA | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.150 | 0.141 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CAAATGTTTCAAGTTCTCTCCTCA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.275 | 0.125 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TGAGGAGAGAACTTGAAACATTTG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=47
0.276 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
This page is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License (CC BY 4.0).