GGGenome Help | English

データベース：
 

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-05 21:43:44, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

TSA: Cannabis sativa PK13566.1_1.CasaPuKu mRNA sequence.
JP450053.1:13-32
TTACCTGCCACC13CAACGCTACCAAATAACGTGTGTCTTCACTCCTTCATCATTATTTTTGTT
Aricia agestis genome assembly, chromosome: 12.
LR990268.1:12548667-12548686
CGAAAAACCGCAACTAACATAGATCTGATA12548667CAACGCTACCAAATAACGTGCCATTTGCCTAAGCATCCACCAAGTTGATC
Clusia tigrina genome assembly, chromosome: 1.
OV050030.1:423652660-423652679
GTGATCAGATACGACCATGTTGACAGTTCG423652660CAACGCTACCAAATAACGTGCAGACTTAGTATAAGAATTAGCGACCCATA
Aricia artaxerxes genome assembly, chromosome: 12.
OW569299.1:13347049-13347068
CGAAAAACCGCAACTAACATAGATCTGATA13347049CAACGCTACCAAATAACGTGCCATTTGCCATCCACCAAGTTGATCTGCTG
Aricia agestis genome assembly, chromosome: 12.
OX101771.1:4008313-4008332
GATCAACTTGGTGGATGCTTAGGCAAATGG4008313CACGTTATTTGGTAGCGTTGTATCAGATCTATGTTAGTTGCGGTTTTTCG

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/CAACGCTACCAAATAACGTG
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : CAACGCTACCAAATAACGTG | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.406 | 0.398 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CAACGCTACCAAATAACGTG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.527 | 0.121 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CACGTTATTTGGTAGCGTTG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=46
0.528 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
This page is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License (CC BY 4.0).