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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-03 12:05:19, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Porphyra yezoensis cDNA clone:PS009g10_r, 5' end.
AV436754.1:417-436
CCCAGGCCGCTGGCGCACTGGGTGGTGTGC417CAAGCCGTCAGTCTTCCTTCCTTCTTCGC
Porphyra yezoensis cDNA clone:PS028g09_r, 5' end.
AV437934.1:264-283
CCCAGGCCGCTGGCGCACTGGGTGGTGTGC264CAAGCCGTCAGTCTTCCTTCCTTCTTCGCTTCGAGTTTTGAGTGTGTGTG
Porphyra yezoensis cDNA clone:PS037a09_r, 5' end.
AV438499.1:480-499
CCCAGGCCGCTGGCGCACTGGGTGGTGTGC480CAAGCCGTCAGTCTTCCTTCCTTCTTCGCTTCGAGTTTTGAGTGTGTG
py086 PY Sporophyte cDNA Library Pyropia yezoensis cDNA, mRNA sequence.
CX873937.1:60-79
CCCAGGCCGCTGGCGCACTGGGTGGTGTGC60CAAGCCGTCAGTCTTCCTTCCTTCTTCGCTTCGAGTTTTGAGTGTGTGTG
Diaphorobacter sp. HDW4A chromosome, complete genome.
CP049910.1:5180044-5180063
CGTGGGGCTGAGGCACGCGTTTTGATGCGT5180044CAAGCCGTCAGTCTTCCTTCATCCCTGTGGCCTTCACCACCTCGCCAAGC
Salmo trutta genome assembly, chromosome: 33.
LR584414.1:43632109-43632128
CAGGTACAAACTAGTATCACACTGCTGAGA43632109GAAGGAAGACTGACGGCTTGTCAATGCCGCCTCGGTGTTGGAATGCAACA

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/CAAGCCGTCAGTCTTCCTTC
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : CAAGCCGTCAGTCTTCCTTC | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.207 | 0.198 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CAAGCCGTCAGTCTTCCTTC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.299 | 0.092 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GAAGGAAGACTGACGGCTTG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=45
0.300 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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