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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
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2025-04-03 15:11:08, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

Musa acuminata subsp. malaccensis strain Doubled-haploid Pahang (DH-Pahang) genome assembly, chromosome: A08.
HG996472.1:1058610-1058629
TTGCAGGCAGGCAACTGAGTCGGAGAACAA1058610TACAGAGTATGGGGCCCTTGAGAATGTGTCTGAGGACAAATCGTTTATGA
Musa schizocarpa genome assembly, chromosome: S08.
LS990922.1:1146660-1146679
TTGCAGGCAGGCAACTGAGTCGGAGAACAA1146660TACAGAGTATGGGGCCCTTGAGAATGTGTCTGAGGACAAATCGTTTATGA

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/CAAGGGCCCCATACTCTGTA
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : CAAGGGCCCCATACTCTGTA | format : html | download : | debug :

0.009 | 0.009 | search_start;
0.136 | 0.127 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CAAGGGCCCCATACTCTGTA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.209 | 0.073 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TACAGAGTATGGGGCCCTTG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.211 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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