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データベース:

ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 +方向のみ検索 -方向のみ検索

2025-04-03 20:56:04, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

Vicia faba genome assembly, chromosome: 1L.
OX451736.1:1464893138-1464893157
GTATTCTTGAGTCTAAGTGATGATAATTGT1464893138TCTGGATGAGGGCTTAATTGAAATTTATTAAGAGTGTATTATTACTTGAG
Symsagittifera roscoffensis genome assembly, chromosome: 6.
OY783239.1:30277180-30277199
CCCCGCCGCTTACGGTGTTGAAATCCAACA30277180TCTGGATGAGGGCTTAATTGTCGTAAAAACAATCGAAAAGTTTTGAAGCT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/CAATTAAGCCCTCATCCAGA
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : CAATTAAGCCCTCATCCAGA | format : html | download : | debug :

0.009 | 0.009 | search_start;
0.190 | 0.182 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CAATTAAGCCCTCATCCAGA&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.284 | 0.093 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=TCTGGATGAGGGCTTAATTG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.285 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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