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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 : 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 +方向のみ検索 -方向のみ検索

2025-04-03 18:05:54, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます(ミスマッチ挿入欠失

Apotomis betuletana genome assembly, chromosome: 1.
OW026299.1:23598346-23598366
ACCACATGCGTCAACAGTGTTGCCAGTGCA23598346CACAAAGTAAAGCAAACGAACAACAGTTTCTATGTATTAAACATGAGCATA
Beta vulgaris subsp. vulgaris genome assembly, chromosome: 4.
OX392550.1:4519907-4519927
ATTAGCCTTGCTTGAATTGCCTCTGGAAAG4519907GTTCGTTTGCTTTACTTTGTGGTGTAATGCTATTTTAATCTTCTGTAACTT
Beta vulgaris subsp. vulgaris genome assembly, chromosome: 4.
OX392559.1:4521190-4521210
ATTAGCCTTGCTTGAATTGCCTCTGGAAAG4521190GTTCGTTTGCTTTACTTTGTGGTGTAATGCTATTTTAATCTTCTGTAACTT
Apotomis turbidana genome assembly, chromosome: 1.
LR990281.1:17611173-17611193
TATGCTCATGTTTAATACATAGAAACTGTT17611173GTTCGTTTGCTTTACTTTGTGTGCACTGGCAACACTGTTGATGTATTTGGT

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/CACAAAGTAAAGCAAACGAAC
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : CACAAAGTAAAGCAAACGAAC | format : html | download : | debug :

0.009 | 0.009 | search_start;
0.374 | 0.365 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CACAAAGTAAAGCAAACGAAC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.478 | 0.105 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GTTCGTTTGCTTTACTTTGTG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=49
0.480 | 0.002 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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